Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN22Q8N7P3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN22Q8N7P3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN22Q8N7P3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN22Q8N7P3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN22Q8N7P3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN22Q8N7P3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN22Q8N7P3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms