Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI3Q8N145 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI3Q8N145 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI3Q8N145 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGI3Q8N145 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI3Q8N145 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI3Q8N145 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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