Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CADM3Q8N126 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CADM3Q8N126 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CADM3Q8N126 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CADM3Q8N126 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CADM3Q8N126 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CADM3Q8N126 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CADM3Q8N126 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CADM3Q8N126 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CADM3Q8N126 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CADM3Q8N126 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADM3Q8N126 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms