Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U7

C1orf87, Uncharacterized protein C1orf87, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf87Q8N0U7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf87Q8N0U7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf87Q8N0U7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf87Q8N0U7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf87Q8N0U7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf87Q8N0U7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf87Q8N0U7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf87Q8N0U7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf87Q8N0U7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms