Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrdQ8K2M3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrdQ8K2M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrdQ8K2M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrdQ8K2M3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrrdQ8K2M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SrrdQ8K2M3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrrdQ8K2M3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrrdQ8K2M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrdQ8K2M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrrdQ8K2M3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrrdQ8K2M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms