Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM4Q8IZR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMTM4Q8IZR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM4Q8IZR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTM4Q8IZR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTM4Q8IZR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMTM4Q8IZR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM4Q8IZR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM4Q8IZR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms