Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR4Q8IZ21 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR4Q8IZ21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR4Q8IZ21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHACTR4Q8IZ21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHACTR4Q8IZ21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR4Q8IZ21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHACTR4Q8IZ21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHACTR4Q8IZ21 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR4Q8IZ21 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms