Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HACE1Q8IYU2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HACE1Q8IYU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HACE1Q8IYU2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACE1Q8IYU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACE1Q8IYU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HACE1Q8IYU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HACE1Q8IYU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HACE1Q8IYU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms