Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCMQ8IYD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCMQ8IYD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCMQ8IYD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCMQ8IYD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCMQ8IYD8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCMQ8IYD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCMQ8IYD8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCMQ8IYD8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FANCMQ8IYD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCMQ8IYD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCMQ8IYD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCMQ8IYD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCMQ8IYD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms