Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY84

NIM1K, Serine/threonine-protein kinase NIM1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1KQ8IY84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NIM1KQ8IY84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NIM1KQ8IY84 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NIM1KQ8IY84 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NIM1KQ8IY84 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NIM1KQ8IY84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NIM1KQ8IY84 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NIM1KQ8IY84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NIM1KQ8IY84 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NIM1KQ8IY84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NIM1KQ8IY84 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NIM1KQ8IY84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NIM1KQ8IY84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms