Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNTD2Q8IXW0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMNTD2Q8IXW0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMNTD2Q8IXW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMNTD2Q8IXW0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMNTD2Q8IXW0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNTD2Q8IXW0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMNTD2Q8IXW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMNTD2Q8IXW0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNTD2Q8IXW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNTD2Q8IXW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNTD2Q8IXW0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms