Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX5

SGPP2, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP2Q8IWX5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGPP2Q8IWX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGPP2Q8IWX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGPP2Q8IWX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGPP2Q8IWX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGPP2Q8IWX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGPP2Q8IWX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP2Q8IWX5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP2Q8IWX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP2Q8IWX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms