Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC103Q8IW40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC103Q8IW40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC103Q8IW40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC103Q8IW40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC103Q8IW40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC103Q8IW40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC103Q8IW40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC103Q8IW40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms