Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
KSR1Q8IVT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KSR1Q8IVT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KSR1Q8IVT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KSR1Q8IVT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KSR1Q8IVT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KSR1Q8IVT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KSR1Q8IVT5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KSR1Q8IVT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KSR1Q8IVT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms