Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps50Q8CI71 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps50Q8CI71 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps50Q8CI71 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps50Q8CI71 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps50Q8CI71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps50Q8CI71 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps50Q8CI71 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps50Q8CI71 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms