Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl1Q8CEQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkl1Q8CEQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms