Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrif1Q8CDD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrif1Q8CDD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrif1Q8CDD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrif1Q8CDD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrif1Q8CDD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrif1Q8CDD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrif1Q8CDD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrif1Q8CDD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrif1Q8CDD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrif1Q8CDD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrif1Q8CDD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrif1Q8CDD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrif1Q8CDD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrif1Q8CDD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrif1Q8CDD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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