Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atxn7l2Q8C8K6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atxn7l2Q8C8K6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atxn7l2Q8C8K6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn7l2Q8C8K6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn7l2Q8C8K6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l2Q8C8K6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn7l2Q8C8K6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn7l2Q8C8K6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn7l2Q8C8K6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn7l2Q8C8K6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn7l2Q8C8K6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms