Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apoa5Q8C7G5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa5Q8C7G5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apoa5Q8C7G5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa5Q8C7G5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoa5Q8C7G5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa5Q8C7G5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoa5Q8C7G5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoa5Q8C7G5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoa5Q8C7G5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms