Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac7Q8C2B3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac7Q8C2B3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac7Q8C2B3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac7Q8C2B3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac7Q8C2B3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac7Q8C2B3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac7Q8C2B3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac7Q8C2B3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac7Q8C2B3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms