Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccz1Q8C1Y8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccz1Q8C1Y8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccz1Q8C1Y8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccz1Q8C1Y8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccz1Q8C1Y8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccz1Q8C1Y8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccz1Q8C1Y8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccz1Q8C1Y8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccz1Q8C1Y8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccz1Q8C1Y8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccz1Q8C1Y8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccz1Q8C1Y8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccz1Q8C1Y8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccz1Q8C1Y8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccz1Q8C1Y8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms