Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp5Q8BX09 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp5Q8BX09 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp5Q8BX09 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp5Q8BX09 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp5Q8BX09 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp5Q8BX09 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms