Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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