Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp9Q8BTS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp9Q8BTS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp9Q8BTS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp9Q8BTS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gbp9Q8BTS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gbp9Q8BTS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp9Q8BTS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp9Q8BTS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gbp9Q8BTS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp9Q8BTS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp9Q8BTS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp9Q8BTS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms