Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLB8

Ankrd34c, Ankyrin repeat domain-containing protein 34C, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34cQ8BLB8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd34cQ8BLB8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd34cQ8BLB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd34cQ8BLB8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd34cQ8BLB8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd34cQ8BLB8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd34cQ8BLB8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34cQ8BLB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34cQ8BLB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34cQ8BLB8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms