Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp5Q8BKN5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp5Q8BKN5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp5Q8BKN5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp5Q8BKN5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubgcp5Q8BKN5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp5Q8BKN5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms