Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prox2Q8BII1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prox2Q8BII1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prox2Q8BII1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prox2Q8BII1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prox2Q8BII1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prox2Q8BII1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prox2Q8BII1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prox2Q8BII1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prox2Q8BII1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prox2Q8BII1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prox2Q8BII1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prox2Q8BII1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prox2Q8BII1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prox2Q8BII1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prox2Q8BII1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prox2Q8BII1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms