Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Best2Q8BGM5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Best2Q8BGM5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Best2Q8BGM5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Best2Q8BGM5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Best2Q8BGM5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Best2Q8BGM5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Best2Q8BGM5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Best2Q8BGM5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Best2Q8BGM5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Best2Q8BGM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Best2Q8BGM5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Best2Q8BGM5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Best2Q8BGM5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Best2Q8BGM5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Best2Q8BGM5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Best2Q8BGM5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms