Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACUL1Q86Y37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACUL1Q86Y37 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACUL1Q86Y37 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACUL1Q86Y37 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACUL1Q86Y37 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACUL1Q86Y37 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACUL1Q86Y37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACUL1Q86Y37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACUL1Q86Y37 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms