Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PATL1Q86TB9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL1Q86TB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL1Q86TB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PATL1Q86TB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL1Q86TB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PATL1Q86TB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PATL1Q86TB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PATL1Q86TB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL1Q86TB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms