Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-M10.2Q85ZW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2-M10.2Q85ZW9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M10.2Q85ZW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2-M10.2Q85ZW9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2-M10.2Q85ZW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2-M10.2Q85ZW9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-M10.2Q85ZW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H2-M10.2Q85ZW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-M10.2Q85ZW9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2-M10.2Q85ZW9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2-M10.2Q85ZW9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms