Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Amigo1Q80ZD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo1Q80ZD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Amigo1Q80ZD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo1Q80ZD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amigo1Q80ZD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Amigo1Q80ZD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo1Q80ZD8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo1Q80ZD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amigo1Q80ZD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Amigo1Q80ZD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms