Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RbsnQ80Y56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RbsnQ80Y56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RbsnQ80Y56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RbsnQ80Y56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RbsnQ80Y56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RbsnQ80Y56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RbsnQ80Y56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RbsnQ80Y56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RbsnQ80Y56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RbsnQ80Y56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RbsnQ80Y56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RbsnQ80Y56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RbsnQ80Y56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms