Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrde2Q80XC6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nrde2Q80XC6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nrde2Q80XC6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nrde2Q80XC6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nrde2Q80XC6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nrde2Q80XC6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrde2Q80XC6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrde2Q80XC6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nrde2Q80XC6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrde2Q80XC6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrde2Q80XC6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrde2Q80XC6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrde2Q80XC6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrde2Q80XC6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nrde2Q80XC6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrde2Q80XC6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrde2Q80XC6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrde2Q80XC6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrde2Q80XC6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrde2Q80XC6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrde2Q80XC6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrde2Q80XC6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrde2Q80XC6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrde2Q80XC6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms