Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6I5

SPATA12, Spermatogenesis-associated protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA12Q7Z6I5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPATA12Q7Z6I5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPATA12Q7Z6I5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPATA12Q7Z6I5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPATA12Q7Z6I5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPATA12Q7Z6I5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPATA12Q7Z6I5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPATA12Q7Z6I5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms