Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBBP6Q7Z6E9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBBP6Q7Z6E9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBBP6Q7Z6E9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBBP6Q7Z6E9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBBP6Q7Z6E9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RBBP6Q7Z6E9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RBBP6Q7Z6E9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RBBP6Q7Z6E9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBBP6Q7Z6E9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RBBP6Q7Z6E9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RBBP6Q7Z6E9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RBBP6Q7Z6E9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RBBP6Q7Z6E9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RBBP6Q7Z6E9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RBBP6Q7Z6E9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RBBP6Q7Z6E9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms