Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDXQ7Z353 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDXQ7Z353 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDXQ7Z353 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDXQ7Z353 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDXQ7Z353 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDXQ7Z353 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HDXQ7Z353 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDXQ7Z353 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDXQ7Z353 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDXQ7Z353 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms