Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rexo1Q7TT28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rexo1Q7TT28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rexo1Q7TT28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rexo1Q7TT28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rexo1Q7TT28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rexo1Q7TT28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rexo1Q7TT28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rexo1Q7TT28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rexo1Q7TT28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rexo1Q7TT28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rexo1Q7TT28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms