Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfsf18Q7TS55 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf18Q7TS55 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf18Q7TS55 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnfsf18Q7TS55 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfsf18Q7TS55 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf18Q7TS55 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms