Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LnpkQ7TQ95 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LnpkQ7TQ95 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LnpkQ7TQ95 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LnpkQ7TQ95 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LnpkQ7TQ95 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LnpkQ7TQ95 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LnpkQ7TQ95 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LnpkQ7TQ95 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LnpkQ7TQ95 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms