Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcg2Q7TMS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcg2Q7TMS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcg2Q7TMS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Abcg2Q7TMS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcg2Q7TMS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcg2Q7TMS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcg2Q7TMS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcg2Q7TMS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcg2Q7TMS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcg2Q7TMS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcg2Q7TMS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcg2Q7TMS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms