Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARCQ7LC44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARCQ7LC44 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARCQ7LC44 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARCQ7LC44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARCQ7LC44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARCQ7LC44 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARCQ7LC44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms