Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP1BQ7LBR1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP1BQ7LBR1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP1BQ7LBR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP1BQ7LBR1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP1BQ7LBR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP1BQ7LBR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP1BQ7LBR1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP1BQ7LBR1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms