Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msrb2Q78J03 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msrb2Q78J03 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msrb2Q78J03 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msrb2Q78J03 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msrb2Q78J03 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msrb2Q78J03 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Msrb2Q78J03 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msrb2Q78J03 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msrb2Q78J03 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msrb2Q78J03 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msrb2Q78J03 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msrb2Q78J03 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msrb2Q78J03 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msrb2Q78J03 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msrb2Q78J03 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msrb2Q78J03 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.9 ms