Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA1AQ71U36 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA1AQ71U36 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA1AQ71U36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA1AQ71U36 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1AQ71U36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBA1AQ71U36 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA1AQ71U36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA1AQ71U36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA1AQ71U36 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA1AQ71U36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA1AQ71U36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA1AQ71U36 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA1AQ71U36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms