Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB2Q71RG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMUB2Q71RG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB2Q71RG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMUB2Q71RG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMUB2Q71RG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMUB2Q71RG4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMUB2Q71RG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms