Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPUQ71F23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPUQ71F23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPUQ71F23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPUQ71F23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPUQ71F23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPUQ71F23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPUQ71F23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPUQ71F23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPUQ71F23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPUQ71F23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPUQ71F23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPUQ71F23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPUQ71F23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPUQ71F23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPUQ71F23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CENPUQ71F23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPUQ71F23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms