Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYS1Q717R9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYS1Q717R9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYS1Q717R9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYS1Q717R9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CYS1Q717R9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYS1Q717R9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CYS1Q717R9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYS1Q717R9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms