Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CREB3L2Q70SY1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L2Q70SY1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CREB3L2Q70SY1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CREB3L2Q70SY1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB3L2Q70SY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3L2Q70SY1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L2Q70SY1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3L2Q70SY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3L2Q70SY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms