Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR3Q6ZTQ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDHR3Q6ZTQ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR3Q6ZTQ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDHR3Q6ZTQ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDHR3Q6ZTQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDHR3Q6ZTQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDHR3Q6ZTQ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDHR3Q6ZTQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDHR3Q6ZTQ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDHR3Q6ZTQ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms